Tras minuciosos estudios realizados a muestras extraídas de la Laguna de Cajititlán, el Instituto Jalisciense de Ciencias Forenses, a través de su Director General, Lic. Marco Antonio Cuevas Contreras, informó a los medios de comunicación y la sociedad jalisciense, sobre las conclusiones arrojadas por los análisis en cuestión.
Falta de oxígeno en el agua fue la causa de muerte en los peces denominados "popochas", lo cual fue originado por la presencia de materia orgánica en el embalse, que llega por la descarga de aguas residuales sobre el mismo. Se encontró, además, que la presencia de organismos coliformes fecales superó hasta en 6 veces el valor máximo permitido por la NOM-003-ECOL-1997 para servicio al público con contacto humano.